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微波殺菌設備是利用電磁場的熱效應進行的殺菌處理
微波殺菌設備是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變化，使細菌失去營養(yǎng)，繁殖和生存的條件而死亡。微波對細菌的生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞膜周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養(yǎng)不良，不能正常新陳代謝，細胞結構功能紊亂，生長發(fā)育受到抑制而死亡。此外，微波能使細菌正常生長和穩(wěn)定遺傳繁殖的核酸RNA和脫氧核糖核酸DNA，是由若干氫鍵松弛，斷裂和重組，從而誘發(fā)遺傳基因突變，或染色體畸變甚至斷裂。
微波殺菌設備殺菌均勻*
常規(guī)熱力殺菌是從物料表面開始，然而通過熱傳導至內部，存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間。往往食品內部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波肯有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部同時受到作用，所以消毒殺菌均勻*。
便于控制，微波干操殺菌處理，設備能即開即用，沒有常規(guī)熱力殺菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率可調，傳輸速度從零開始連續(xù)可調，便于操作。
設備簡單，工藝與常規(guī)方法相比，微波設備不需要鍋爐、復雜的管道系統，煤場和運輸車輛，只要具備水，電基本條件即可。改善勞動條件，節(jié)省占地面積設備的工作環(huán)境低、噪音小，改善了勞動條件，整套微波設備的操作只需2-3人。
殺菌：微波殺菌在食品工業(yè)中早已得到應用，利用微波均勻加熱至70--80℃時，時間保持1~2分鐘，可以使一般的腸道菌、酵母菌和霉菌基本殺滅，但殺滅原生孢子須在121--130℃溫度下保持3-4分鐘。